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Hola Compañeros y Colegas!

Luego de 1 año intenso de estudios, se cumple el plazo de 3 semestres de investigación sub graduada. Han sido 3 semestres difíciles pero bien maravillosos en términos educativos y en lo personal, ya que me he enriquecido de experiencias científicas y he ganado muchas amistades. He cumplido muchos de mis objetivos, otros no, han surgido unos nuevos, etc…así es que funciona un laboratorio de investigación. A pesar de que trabajé los 3 semestres en el mismo proyecto, no me arrepiento porque se aprende a trabajar duro y cogerle cariño al trabajo que uno hace.

Bueno…hablemos de ciencia. Sigo en el laboratorio de la Dra. Elsie Parés y continuo laboreando en mi proyecto titulado: Expresión y Caracterización de la proteína FAP1. Ya he posteado todo las técnicas que he aprendido y utilizado. A continuación mi ultimo resumen o abstract de mi trabajo para que tengan una idea de cómo voy finalizando.

Las células de la levadura Saccharomyces cerevisiae expresan la proteína FAP1, la cual es homóloga al factor de transcripción humano NF-X1.  Ambas proteínas contienen regiones de enlace al DNA llamadas dedos de cinc, con las cuales pueden regular la expresión de otros genes.  En estudios iniciales, bacterias electrocompetentes de la cepa BL-21 fueron transformadas con los vectores recombinados pGEM:FAP1(IF) y pGEM:FAP1(Rev), y también con los vectores originales pGEM y pBluescript (KS).  La inducción de los genes fap1 y/o lac-z fue mediante la ayuda del agente IPTG.  En ese entonces, las bandas de proteínas no pudieron ser vistas por SDS-PAGE debido a problemas con la preparación del extracto proteico crudo.  En este semestre, extractos proteicos crudos fueron preparados con la ayuda de un procedimiento desnaturalizante y otro no-desnaturalizante.  Los resultados obtenidos de SDS-PAGE mostraron que tanto los extractos proteicos crudos de las bacterias transformadas con pGEM:FAP1(IF) como con pGEM:FAP1(Rev) no contienen la proteína FAP1 expresada.  Sin embargo, sí se pudo observar que ambas técnicas (desnaturalizante y no-desnaturalizante) son bastante eficientes como para obtener extractos proteicos crudos en muy buen estado.  En un intento por confirmar que la activación del gen fap1 no estuviese comprometida, bacterias de la cepa BL-21 fueron también transformadas con el plasmidio recombinado pBKS 544/483.  Al igual que con los cultivos bacteriales anteriores, la expresión del gen lac-z fue monitoreada después de añadir el sustrato para la enzima ß-galactosidasa llamado X-gal.  Luego de una hora de reacción, el cultivo bacterial que contenía las bacterias transformadas con pBKS 544/483 mostró la ausencia característica del color azul en el medio como resultado de la inactivación del gen lac-z, mientras que los cultivos bacteriales con los plasmidios originales llegaron a mostrar el color azul como resultado de la activación eficiente del gen lac-z por la acción de IPTG.

Ahora entraré en las evaluaciones de los 3 afiches o “posters” que pude ver en el BioMinds Poster Day. Empezaré con el de la estudiante subgraduada del Recinto de Rio Piedras en la categoría de Biología Molecular, Andrea Rivera. Su proyecto se titular: Undertstanding The Role of Phosphorylation in the Nonsense-Mediated mRNA Decay (NMD) Pathway. Trataba sobre como la ruta o pathway de NMD funcionaba en reconocer y degradar  los “mRNA harboring prmature termination codons (PTC), los cuales pueden causar enfermedades genéticas y cáncer. La estudiante me explico sus experimentos y resultados acerca de cómo Upf2p se fosforila y de cómo esto es crucial en la actividad de NMD. Me gustó como ella manejaba esta información, ya que es un tema bien difícil y ella es estudiante de segundo año, o sea que desde prepa esta trabajando, lo cual se lo amerito mucho. Otro punto es que trabajo con una proteína de levadura al igual que hago yo. Su trabajo también tiene aplicaciones futuras en el campo de la medicina, lo cual es muy importante. Ella me contestó todas mis preguntas de forma muy segura y organizada y mostrando siempre un interés genial. En relación al poster lo noté bien organizado y completo. ¡Éxito Andrea!

El segundo poster que evalué fue el de la estudiante V. Román del Recinto de Humacao. Su categoría fue Microbiología y su proyecto se titula: The Effect of Wastewater Influx in the Nutrient Composition  and Abundance of Antoxygenic Photothrophs in Tropical Dairy Wastewater Lagoons. De su trabajo me llamó la atención que ella hizo trabajo de campo, uno de los roles de un buen biólogo. Y también me conto que su tema surgió de una simple pregunta: ¿Por qué el agua se torna color roja? Resumiendo su trabajo trata sobre comparar el efecto de las aguas de desperdicios diarias en granjas en las lagunas de oxidación y en la composición de los nutrientes y la abundancia de bacterias fotótrofas anoxigenicas. Básicamente lo que hicieron fue recopilar muestras de aguas de esas lagunas y analizarlas para determinar los nutrientes y pigmentos. La estudiante me explico todo el proceso y se noto que fue uno arduo pero interesante, el cual ella aprendió a su totalidad. Actualmente están en el proceso de aislar la bacteria responsable de que el agua se torne roja y de identificarla. Su poster fue uno bien sencillo pero que te explicaba todo bien detalladamente. V. Román de tercer año logró cautivar mi interés, ya que estuve más de 10 minutos en su poster y entendí su aplicación tan importante dentro de las industrias pecuarias de nuestro país. Felicidades y sigue hacia adelante.

El tercer afiche que evalue fue el de la estudiante Adriana O. Díaz. Ella es del recinto de Cayey su trabajo cae en la categoría de Microbiología. Potential Protein-Protein Interaction Motifs in Envelope Glycoprotein of Dengue Virus and other Flavirus, fue su tema. Como todos sabemos el dengue es un virus de hebra sencilla de RNA perteneciente a la familia de los Flavirus. Este virus es bien común en PR y es sumamente peligroso. Su interacción con las células dendríticas es mediante un receptor en la membrana de las células y su “envelope protein”. Fue así que ella y su equipo trabajaron en identificar esos motifs para entender la patofisiología del virus. Este trabajo fue bien peculiar porque ella me explicó muy bien como se hacía eso. Buscaron las secuencias de las proteínas y mediante un programa de computadora, el cual estaban aprendiendo a utilizar,  lograron identificar la estructura 3D de esas interacciones proteína-proteína. Me gustó mucho porque a pesar de ser estudios teóricos, se demostró muy bien que tienen data para seguir con su trabajo. La estudiante no fue la excepción, ya que también entendí todo muy bien gracias a sus explicaciones. Su poster fue uno bien llamativo y bonito por todas sus imágenes que explicaban todo muy bien. ¡Éxito!

Para concluir me gustaría decir que las 3 estudiantes hicieron un trabajo extraordinario en todos los aspectos. Además me gustó poder dialogar y compartir conocimientos científicos con estudiantes de otros recintos. Les deseo a todos mucho éxito y suerte en sus trabajos y a los que se gradúan como yo……apenas estamos empezando….mucho ÉXITO! Felices vacaciones y cualquier cosita me pueden escribir en confianza. Nuevamente gracias a BioMinds por su gran ayuda y hasta luego…

Att.

Luis J. Bello Class